La flago de Madejro estas de blua-ora-blua vertikala flago kun ruĝ-limigita blanka krista kruco en la centro. Multaj postulis ĝian dizajnon esti inspirita per la flago de la nun forpasinta Liberiga Fronto de Madejra Arkipelago.

Flag ratio: 2:3

La bluo simbolas la insulecon de ĉi tiu portugala aŭtonoma regiono, flavo reprezentas la mildan klimaton kaj sablaron de la insuloj kiuj konstituas unu el ĝiaj plejaj riĉaĵ-fontoj.

La kruco de la Ordeno de Kristo aludas la malkovron de Madejro fare de du kavaliroj kiuj apartenis al ĉi tiu ordeno, João Gonçalves Zarco kaj Tristão Vaz Teixeira, kaj la aliĝo al la Portugala Respubliko.