Filogeneza arbo: Malsamoj inter versioj

[nekontrolita versio][nekontrolita versio]
Enhavo forigita Enhavo aldonita
Neniu resumo de redakto
 
aldonis difinan frazon
Linio 1:
'''Filogenetika arbo''' estas arboforma skemo, kiu bildigas kiel el unu [[specio]] [[evoluo|evoluis]] pluraj.
 
:'''Filogenetikaj diskutoj/vidpunktoj:'''
 
Linio 25 ⟶ 27:
\/
\_______________ [[Eŭkarioto|Eŭkariotoj]]
 
 
<!-- Damit ist ein phylogenetischer Baum eine Form des
[[Kladogramm]]s.
 
In einem phylogenetischen Baum repräsentiert jeder [[Knoten (Graphentheorie)|Knoten]] mit Vorfahren den ''nächsten gemeinsamen
Verwandten'' dieser Vorfahren. Die Kantenlänge entspricht meist der
geschätzten Zeit, in der sich die Arten separiert haben, oder der
Anzahl der [[Mutation]]en, die während dieser Entwicklung passierten.
Jeder Knoten in einem phylogenetischen Baum wird als ''taxonomische
Einheit'' bezeichnet, wobei man innere Knoten oft als ''hypothetische
taxonomische Einheiten'' bezeichnet, wenn die entsprechenden Arten
oder Einheiten nicht beobachtet werden können.
 
==Datenquellen und Interpretation==
 
Phylogenetische Bäume werden heute meist anhand von [[Sequenzanalyse|sequenzierten]]
[[Gen]]en der untersuchten Spezies aufgebaut. Dabei berechnet man ein
[[Sequenzalignment]] des gleichen Gens (oder evtl. der gleichen Gene)
dieser Arten, und verwendet die im Alignment erscheinenden
Ähnlichkeiten und Unterschiede, um den Baum aufzubauen. Arten, deren
Sequenzen ähnlich sind, liegen im Baum dann wahrscheinlich näher
beieinander als solche mit stark unterschiedlichen Sequenzen. Da die [[Zeitkomplexität|Komplexität]] der Berechnung solcher Bäume jedoch mit der Anzahl der Sequenzen exponentiell ansteigt, verwendet man [[Heuristik]]en, um die Bäume zu generieren.
 
Ziel der Erstellung phylogenetischer Bäume ist es, die Evolution möglichst detailliert zu erklären. Allerdings weiß man heute, dass die Gene sich nicht gleichmäßig
entwickelt haben. Einige Gene, die heute im [[Körper des Menschen]]
vorkommen, haben beispielsweise nur gemeinsame Vorfahren mit dem
[[Schimpanse]]n, andere kommen in allen [[Säugetier]]en vor, etc.
 
Deshalb können bei der phylogenetischen Analyse verschiedener Gene der
gleichen Spezies unterschiedliche phylogenetische Bäume entstehen, die
für sich jedoch alle korrekt sind. Um die Entstehungspunkte und
Verzweigungen bei der Evolution der
einzelnen Arten festzustellen, müssen deshalb verschiedene Genregionen
untersucht werden. Weiterhin sollten Ergebnisse aus der klassischen
[[Phylogenie]] sowie morphologische Merkmale zur Interpretation
hinzugezogen werden.
 
==Gewurzelte und ungewurzelte Bäume==
Ein ''gewurzelter'' phylogenetischer Baum ist ein gerichteter Baum
mit einem einzelnen Knoten, der dem (meist rechnerisch ermittelten)
nächsten gemeinsamen Vorfahren aller Einheiten im Baum entspricht.
 
Ein ''ungewurzelter'' Baum dagegen besitzt keinen ausgezeichneten
nächsten gemeinsamen Vorfahren, sondern soll lediglich die
Verwandtschaftsnähe oder -ferne der einzelnen Arten
darstellen. Näheres zu gewurzelten und ungewurzelten Bäumen ist im
Artikel [[Wälder und Bäume in der Graphentheorie]] nachzulesen.
 
==Kritik==
* Per Definition können phylogenetische ''Bäume'' [[Hybridisierung (Molekularbiologie)|Hybridisierung]] und [[lateraler Gentransfer|lateralen Gentransfer]], die ebenfalls wichtige Methoden der Genübertragung sind, nicht darstellen. Deshalb vertreten einige Forscher die Ansicht, dass man nicht einen ''Baum'' sondern vielmehr ein phylogenetisches [[Netz]] aufbauen sollte (das sich im Sinne der [[Graphentheorie]] von einem Baum dadurch unterschiedet, dass es "Querverbindungen" zwischen sonst nicht direkt verwandten Arten zulässt).
 
* Bäume, die [[aussterben|ausgestorbene]] Arten nicht enthalten, müssen mit Vorsicht interpretiert werden (siehe auch obige Bemerkung zur Interpretation).
 
==Literatur==
[[Arndt von Haeseler]], [[Dorit Liebers]]: ''Molekulare Evolution'',
Fischer 2003, ISBN 3596153654
 
==Siehe auch==
 
* [[Dendrogramm]]
* [[evolutionärer Stammbaum]]-->
 
----
[[de:Phylogenetischer Baum]]
[[en:Phylogenetic tree]]
[[vi:Cây phát sinh chủng loại]]