Zuse ricevis ok honorajn doktortitolojn kaj du honorajn profesortitolojn. Laŭ li oni nomis du medalojn, unu de la "Gesellschaft für Informatik" (societo por informadiko) kaj unu de la "Zentralverband des deutschen Baugewerbes" (centra asocio de la germana konstrufako). Li ricevis la [[Wilhelm-Leuschner]]-medalon, la [[Werner-von-Siemens]]-ringon kaj la germanan merit-ordenon ([[Bundesverdienstkreuz]]).