Zigomikotoj (Zygomycota) estis filumo de malsuperaj mikroskopaj fungoj, ampleksanta la klasojn zigomicetoj (Zygomycetes) kaj Trichomycetes; ĉ. 1060 specioj el 173 genroj (PIV). Ĝi ne estas natura klado kaj ĝi ne plu estas uzata en moderna taksonomio.