ISAAC komponis larĝan varion de muziko, incluzivas [[Meso (muziko)|meson]], [[moteto]]n, Germanan and Italian [[kanto]]n kaj [[musika instrumento|instrumentan]] muzikon. Li estis unu de la plej fekundaj komponistoj de liasia tempo, sed liasia verko estis larĝe malatentata en favoro de JOSQUIN (kvankam la komponisto [[Anton WEBERN]] verkis lian tezon sur ISAAC). Lia plejbona konata verko estas probable la [[kanto]] ''Innsbruck, ich muss dich lassen'', de kiu li faris minimume du versiojn. Ĝi estas ebla, tamen, ke la [[melodio]] mem ne estas de ISAAC, kaj nur la fiksaĵomuzikigo estas originala. La sama melodio estis poste uzata kiel la temo por la [[Lutera kirko|Lutera]] [[koralo]] ''O Welt, ich muss dich lassen'', kiu estis la bazo de verkoj de [[Johann Sebastian BACH]] kaj [[Johannes BRAHMS]]. ISAAC ankaŭ verkis almenaŭ 40 Mesojn Ordinarajn.
Sur lia morto, Isaac lasis lian ''Choralis Constantinus'' nekomplete. Ĝi estas la unua konata kompleta fiksaĵomuzikigo de la Deco de la Meso por la tuta jaro, enhavis ĉirkaŭ cent fiksaĵojnmuzikigojn. [[Ludwig SENFL]], lernisto de ISAAC, kompletis la serion, sed ĝi ne eldoniĝis ĝis [[1555]], post lia morto. ISAAC ankaŭ verkis almenaŭ 40 Meso Ordinaraj.
